加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院的研究人员开发了一种新的生物信息学框架，已从糖尿病肾病患者的活检组织中鉴定出在基因表达水平上显着改变的关键蛋白质，其结果可能揭示了新的治疗靶标。

在最近发表的论文JCI见解，研究人员通过库马尔·夏尔马，MD，教授领导的医学在医学加州大学圣地亚哥分校，发现该蛋白MDM2是一致的下调，在发挥了关键作用糖尿病肾病的进展。研究人员使用新的“ MetBridge Generator”生物信息学框架来鉴定相关的酶和桥蛋白，这些酶和桥蛋白在分子水平上将人类代谢组学数据与糖尿病肾病的病理生理学联系起来。

“ MetBridge Generator可以对糖尿病肾病患者的尿液代谢组学数据进行有效，集中的分析，为研究人员提供了基于关键蛋白可能在细胞或生理上的作用开发新假说的机会，”该研究的高级作者兼主任Sharma说。加州大学圣地亚哥分校医学院的代谢组学研究所和肾脏转化医学中心。“该框架还可用于解释多种疾病的其他代谢组学特征。例如，MDM2也参与调节肿瘤蛋白p53，这是癌症治疗的目标。”

在先前的研究中，作者确定了13种代谢物，这些代谢物被发现在糖尿病肾病患者中发生了改变。将这些信息与有关代谢途径的公开数据相结合，研究人员检验了一种假设，即某些蛋白质充当桥梁，从而建立了不太明确的途径。然后，框架创建了代谢和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的地图。这使研究小组能够更深入地研究与调节糖尿病肾病的13种代谢物特征的酶发生最多相互作用的相关桥梁。

作者已经确定蛋白质-RNA相互作用是可能成为疾病进展的其他关键途径的可能来源，这些途径可能会添加到MetBridge Generator网络中。这种增长将继续增加可能的疾病治疗目标。